Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2IP63279 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2IP63279 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms