Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP4BP1P59074 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms