Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDF10P55107 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF10P55107 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF10P55107 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF10P55107 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF10P55107 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF10P55107 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF10P55107 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF10P55107 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF10P55107 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF10P55107 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF10P55107 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF10P55107 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms