Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HADHBP55084 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HADHBP55084 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HADHBP55084 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HADHBP55084 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHBP55084 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HADHBP55084 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HADHBP55084 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHBP55084 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHBP55084 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHBP55084 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms