Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA8P53708 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA8P53708 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA8P53708 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA8P53708 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA8P53708 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA8P53708 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms