Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP11P51784 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP11P51784 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP11P51784 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP11P51784 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP11P51784 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP11P51784 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP11P51784 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP11P51784 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP11P51784 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP11P51784 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP11P51784 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP11P51784 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP11P51784 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms