Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB28P51157 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB28P51157 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB28P51157 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB28P51157 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB28P51157 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB28P51157 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB28P51157 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms