Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GATMP50440 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GATMP50440 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATMP50440 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATMP50440 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATMP50440 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATMP50440 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATMP50440 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms