Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RARRES1P49788 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms