Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC11A1P49279 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC11A1P49279 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms