Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GALR1P47211 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GALR1P47211 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GALR1P47211 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GALR1P47211 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GALR1P47211 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GALR1P47211 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GALR1P47211 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GALR1P47211 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GALR1P47211 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GALR1P47211 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms