Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTTP42858 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTTP42858 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HTTP42858 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTTP42858 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTTP42858 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTTP42858 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTTP42858 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTTP42858 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTTP42858 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTTP42858 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTTP42858 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTTP42858 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTTP42858 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTTP42858 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HTTP42858 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTTP42858 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTTP42858 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTTP42858 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms