Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms