Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIK1P39086 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms