Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ITGAEP38570 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms