Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDIT3P35638 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms