Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT9P35527 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT9P35527 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT9P35527 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT9P35527 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms