Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM5P33992 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM5P33992 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM5P33992 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM5P33992 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM5P33992 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM5P33992 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM5P33992 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM5P33992 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM5P33992 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM5P33992 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM5P33992 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM5P33992 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM5P33992 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM5P33992 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM5P33992 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM5P33992 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM5P33992 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM5P33992 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM5P33992 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCM5P33992 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms