Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms