Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA7P31268 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms