Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLIP1P30622 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms