Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP1P29466 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP1P29466 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP1P29466 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP1P29466 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP1P29466 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms