Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF8P28908 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms