Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCAP28676 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCAP28676 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCAP28676 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCAP28676 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCAP28676 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCAP28676 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCAP28676 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCAP28676 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCAP28676 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCAP28676 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GCAP28676 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCAP28676 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCAP28676 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCAP28676 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCAP28676 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms