Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHMLP26374 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHMLP26374 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHMLP26374 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHMLP26374 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHMLP26374 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMLP26374 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms