Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFX1P22670 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFX1P22670 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX1P22670 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX1P22670 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX1P22670 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX1P22670 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX1P22670 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX1P22670 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX1P22670 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX1P22670 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX1P22670 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX1P22670 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms