Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR1D1P20393 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR1D1P20393 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR1D1P20393 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR1D1P20393 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NR1D1P20393 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NR1D1P20393 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms