Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF4P18085 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF4P18085 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF4P18085 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF4P18085 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms