Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB9P17482 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms