Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMC1P11047 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms