Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALM2P0DP24 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALM2P0DP24 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALM2P0DP24 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms