Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETSIPP0DME0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms