Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PKHD1P08F94 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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