Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI1P08151 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI1P08151 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI1P08151 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms