Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDN1P05305 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDN1P05305 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDN1P05305 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDN1P05305 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDN1P05305 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDN1P05305 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDN1P05305 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDN1P05305 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDN1P05305 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDN1P05305 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDN1P05305 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDN1P05305 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDN1P05305 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EDN1P05305 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDN1P05305 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDN1P05305 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDN1P05305 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDN1P05305 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDN1P05305 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDN1P05305 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDN1P05305 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDN1P05305 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms