Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOA1P02647 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms