Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM20BO75063 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM20BO75063 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms