Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM6AO15550 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM6AO15550 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms