Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PEX7O00628 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX7O00628 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX7O00628 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX7O00628 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX7O00628 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms