Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP1O00294 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP1O00294 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP1O00294 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP1O00294 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP1O00294 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP1O00294 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP1O00294 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP1O00294 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP1O00294 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP1O00294 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP1O00294 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP1O00294 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP1O00294 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP1O00294 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP1O00294 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP1O00294 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP1O00294 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP1O00294 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TULP1O00294 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TULP1O00294 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms