Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H7C1H1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H7C1H1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H7C1H1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H7C1H1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H7C1H1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H7C1H1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H7C1H1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H7C1H1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms