Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms