Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VGLL3A8MV65 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VGLL3A8MV65 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms