Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK8

FAM196B, Protein FAM196B, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM196BA6NMK8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM196BA6NMK8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM196BA6NMK8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms