Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6L3A6NEY3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6L3A6NEY3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms