Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALM3A6NDB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms