Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMB4A4D0S4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMB4A4D0S4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LAMB4A4D0S4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMB4A4D0S4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMB4A4D0S4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms