Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.386e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.076e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.396e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 223.65■■□□□ 1.386e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.126e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.516e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-203ENST00000527537 3403 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.26e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 36.29□□□□□ -1.43e-8■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.446e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 510.6□□□□□ -0.711e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-206ENST00000508119 735 ntTSL 29.7□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)4.81□□□□□ -1.641e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-206ENST00000468255 1792 ntTSL 515.87■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.041e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 221.62■■□□□ 1.055e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-214ENST00000508787 568 ntTSL 35.54□□□□□ -1.528e-10■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 223.5■■□□□ 1.353e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-20■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 MINOS1-208ENST00000498067 481 ntTSL 222.66■■□□□ 1.228e-8■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 MINOS1-204ENST00000479642 576 ntTSL 317.65■□□□□ 0.428e-8■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 MTCH1-205ENST00000471737 629 ntTSL 214.15□□□□□ -0.142e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ZKSCAN8-204ENST00000606198 2057 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.912e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-208ENST00000470243 721 ntTSL 57.12□□□□□ -1.272e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 VCP-205ENST00000479300 559 ntTSL 1 (best)6.98□□□□□ -1.292e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.462e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 RPL29-206ENST00000481629 880 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-12■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 RPL29-207ENST00000486565 574 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.193e-12■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-214ENST00000564284 603 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 11.9
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-226ENST00000570284 701 ntTSL 516.65■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 11.9
UTP3Q9NQZ2 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 316.5■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-206ENST00000615512 751 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-202ENST00000431926 1354 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.124e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 215.78■□□□□ 0.124e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.074e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-203ENST00000502795 580 ntTSL 414.93□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-204ENST00000582274 541 ntTSL 214.86□□□□□ -0.034e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-209ENST00000510872 577 ntTSL 412.87□□□□□ -0.354e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 29.64□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-204ENST00000580649 2191 ntTSL 29.64□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-203ENST00000538432 533 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GABRE-205ENST00000465405 706 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.914e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 29.33□□□□□ -0.924e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-204ENST00000546931 902 ntTSL 59.15□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-203ENST00000546739 567 ntTSL 48.62□□□□□ -1.034e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-207ENST00000507863 582 ntTSL 48.44□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-208ENST00000552395 671 ntTSL 58.22□□□□□ -1.094e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-205ENST00000548538 594 ntTSL 57.16□□□□□ -1.264e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-214ENST00000508329 448 ntTSL 56.94□□□□□ -1.34e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.334e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.464e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.49□□□□□ -1.532e-22■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 NONO-204ENST00000413858 855 ntTSL 38.49□□□□□ -1.055e-11■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 NONO-208ENST00000454976 726 ntTSL 46.1□□□□□ -1.435e-11■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 RTN4-214ENST00000486085 955 ntTSL 310.81□□□□□ -0.686e-8■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.143e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-208ENST00000492277 537 ntTSL 316.78■□□□□ 0.283e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-201ENST00000294189 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.633e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-205ENST00000480306 719 ntTSL 29.37□□□□□ -0.913e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.73e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-6■■□□□ 11.6
UTP3Q9NQZ2 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 11.6
UTP3Q9NQZ2 CORO1C-206ENST00000546705 577 ntTSL 314.31□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-211ENST00000528314 559 ntTSL 222.84■■□□□ 1.251e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-213ENST00000528377 898 ntTSL 222.29■■□□□ 1.161e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 FASN-202ENST00000578424 951 ntTSL 219.47■□□□□ 0.711e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 FASN-204ENST00000580382 681 ntTSL 318.54■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-225ENST00000599225 281 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-212ENST00000580682 635 ntTSL 39.7□□□□□ -0.861e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-209ENST00000580406 937 ntTSL 38.79□□□□□ -11e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.15□□□□□ -1.911e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 310.13□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 49.09□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.152e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 217.15■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 ANP32B-203ENST00000486769 400 ntTSL 212.22□□□□□ -0.454e-15■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-213ENST00000481648 389 ntTSL 311.33□□□□□ -0.66e-9■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-219ENST00000593101 578 ntTSL 416.72■□□□□ 0.271e-6■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-207ENST00000503170 461 ntTSL 417.59■□□□□ 0.412e-14■□□□□ 11.3
UTP3Q9NQZ2 LDHB-206ENST00000470985 678 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 11.3
UTP3Q9NQZ2 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-9■□□□□ 11.2
UTP3Q9NQZ2 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 27.38□□□□□ -1.232e-9■□□□□ 11.2
UTP3Q9NQZ2 NACA-205ENST00000546410 600 ntTSL 27.17□□□□□ -1.262e-9■□□□□ 11.2
UTP3Q9NQZ2 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1H1-207ENST00000555800 474 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1H1-202ENST00000553423 539 ntTSL 44.99□□□□□ -1.611e-7■□□□□ 11.1
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