Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.386e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.076e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.396e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 223.65■■□□□ 1.386e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.126e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.516e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-203ENST00000527537 3403 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.26e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 36.29□□□□□ -1.43e-8■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.446e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 510.6□□□□□ -0.711e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-206ENST00000508119 735 ntTSL 29.7□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)4.81□□□□□ -1.641e-7■■□□□ 12.2
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-206ENST00000468255 1792 ntTSL 515.87■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.041e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 221.62■■□□□ 1.055e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-214ENST00000508787 568 ntTSL 35.54□□□□□ -1.528e-10■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 223.5■■□□□ 1.353e-6■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-20■■□□□ 12.1
UTP3Q9NQZ2 MINOS1-208ENST00000498067 481 ntTSL 222.66■■□□□ 1.228e-8■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 MINOS1-204ENST00000479642 576 ntTSL 317.65■□□□□ 0.428e-8■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 MTCH1-205ENST00000471737 629 ntTSL 214.15□□□□□ -0.142e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ZKSCAN8-204ENST00000606198 2057 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.912e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-208ENST00000470243 721 ntTSL 57.12□□□□□ -1.272e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 VCP-205ENST00000479300 559 ntTSL 1 (best)6.98□□□□□ -1.292e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.462e-7■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 RPL29-206ENST00000481629 880 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-12■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 RPL29-207ENST00000486565 574 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.193e-12■■□□□ 12
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-214ENST00000564284 603 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 11.9
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-226ENST00000570284 701 ntTSL 516.65■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 11.9
UTP3Q9NQZ2 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 316.5■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-206ENST00000615512 751 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-202ENST00000431926 1354 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.124e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 215.78■□□□□ 0.124e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.074e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-203ENST00000502795 580 ntTSL 414.93□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-204ENST00000582274 541 ntTSL 214.86□□□□□ -0.034e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-209ENST00000510872 577 ntTSL 412.87□□□□□ -0.354e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 29.64□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-204ENST00000580649 2191 ntTSL 29.64□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 ATP5H-203ENST00000538432 533 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GABRE-205ENST00000465405 706 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.914e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 29.33□□□□□ -0.924e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-204ENST00000546931 902 ntTSL 59.15□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-203ENST00000546739 567 ntTSL 48.62□□□□□ -1.034e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-207ENST00000507863 582 ntTSL 48.44□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-208ENST00000552395 671 ntTSL 58.22□□□□□ -1.094e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-205ENST00000548538 594 ntTSL 57.16□□□□□ -1.264e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-214ENST00000508329 448 ntTSL 56.94□□□□□ -1.34e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.334e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.464e-6■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.49□□□□□ -1.532e-22■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 NONO-204ENST00000413858 855 ntTSL 38.49□□□□□ -1.055e-11■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 NONO-208ENST00000454976 726 ntTSL 46.1□□□□□ -1.435e-11■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 RTN4-214ENST00000486085 955 ntTSL 310.81□□□□□ -0.686e-8■■□□□ 11.8
UTP3Q9NQZ2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.143e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-208ENST00000492277 537 ntTSL 316.78■□□□□ 0.283e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-201ENST00000294189 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.633e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-205ENST00000480306 719 ntTSL 29.37□□□□□ -0.913e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.73e-12■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 11.7
UTP3Q9NQZ2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-6■■□□□ 11.6
UTP3Q9NQZ2 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 11.6
UTP3Q9NQZ2 CORO1C-206ENST00000546705 577 ntTSL 314.31□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-211ENST00000528314 559 ntTSL 222.84■■□□□ 1.251e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-213ENST00000528377 898 ntTSL 222.29■■□□□ 1.161e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 FASN-202ENST00000578424 951 ntTSL 219.47■□□□□ 0.711e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 FASN-204ENST00000580382 681 ntTSL 318.54■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-225ENST00000599225 281 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-212ENST00000580682 635 ntTSL 39.7□□□□□ -0.861e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-209ENST00000580406 937 ntTSL 38.79□□□□□ -11e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.15□□□□□ -1.911e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 310.13□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 49.09□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.152e-6■■□□□ 11.5
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 217.15■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 ANP32B-203ENST00000486769 400 ntTSL 212.22□□□□□ -0.454e-15■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-213ENST00000481648 389 ntTSL 311.33□□□□□ -0.66e-9■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-219ENST00000593101 578 ntTSL 416.72■□□□□ 0.271e-6■■□□□ 11.4
UTP3Q9NQZ2 RACK1-207ENST00000503170 461 ntTSL 417.59■□□□□ 0.412e-14■□□□□ 11.3
UTP3Q9NQZ2 LDHB-206ENST00000470985 678 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 11.3
UTP3Q9NQZ2 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-9■□□□□ 11.2
UTP3Q9NQZ2 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 27.38□□□□□ -1.232e-9■□□□□ 11.2
UTP3Q9NQZ2 NACA-205ENST00000546410 600 ntTSL 27.17□□□□□ -1.262e-9■□□□□ 11.2
UTP3Q9NQZ2 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1H1-207ENST00000555800 474 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1H1-202ENST00000553423 539 ntTSL 44.99□□□□□ -1.611e-7■□□□□ 11.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3921.8 ms