Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-202ENST00000366210 672 ntTSL 39.02□□□□□ -0.979e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 EIF3J-207ENST00000558353 1024 ntTSL 58.86□□□□□ -0.999e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 PRKAR2B-202ENST00000393613 642 ntTSL 38.85□□□□□ -0.999e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.039e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-211ENST00000526574 489 ntTSL 58.6□□□□□ -1.039e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 38.3□□□□□ -1.089e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-222ENST00000449239 599 ntTSL 27.85□□□□□ -1.159e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 47.23□□□□□ -1.259e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 CLTC-205ENST00000472651 665 ntTSL 25.44□□□□□ -1.549e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.549e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ATP5E-202ENST00000395659 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-206ENST00000465881 883 ntTSL 57.98□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-215ENST00000638589 2225 ntTSL 26.02□□□□□ -1.452e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 317.23■□□□□ 0.359e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.484e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-204ENST00000563985 688 ntTSL 214.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-203ENST00000562017 903 nt14.14□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-205ENST00000567300 416 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 FAM182B-203ENST00000424021 605 ntTSL 515.25■□□□□ 0.035e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-202ENST00000585540 501 ntTSL 314.62□□□□□ -0.075e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.395e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.565e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.625e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.695e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 PPP2CA-204ENST00000495833 739 ntTSL 29.39□□□□□ -0.915e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STX2-202ENST00000344271 661 ntTSL 37.98□□□□□ -1.135e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.045e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.665e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-205ENST00000519690 3119 ntTSL 216.69■□□□□ 0.265e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 513.55□□□□□ -0.245e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 312.4□□□□□ -0.425e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 516.13■□□□□ 0.175e-15■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.015e-15■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.55□□□□□ -1.523e-8■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-204ENST00000478340 962 ntTSL 219■□□□□ 0.638e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-205ENST00000490335 632 ntTSL 216.96■□□□□ 0.318e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-203ENST00000467020 1069 ntTSL 316.07■□□□□ 0.168e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-202ENST00000464112 1063 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.218e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.48e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 WARS-233ENST00000556660 584 ntTSL 411.05□□□□□ -0.643e-8■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 WARS-213ENST00000554084 866 ntTSL 58.09□□□□□ -1.113e-8■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A37-209ENST00000521637 503 ntTSL 319.46■□□□□ 0.712e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A37-210ENST00000522164 571 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.48□□□□□ -1.374e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.286e-9■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 316.24■□□□□ 0.195e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 212.81□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 312.8□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 212.27□□□□□ -0.455e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 210.29□□□□□ -0.765e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 29.09□□□□□ -0.955e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.965e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.285e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.445e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 56.03□□□□□ -1.445e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 24.11□□□□□ -1.755e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 TMED9-202ENST00000505521 925 ntTSL 219.72■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 13.1
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-216ENST00000564656 552 ntTSL 415.99■□□□□ 0.155e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-206ENST00000561539 509 ntTSL 37.76□□□□□ -1.175e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt22.9■■□□□ 1.266e-7■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.67■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-20■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.98□□□□□ -1.771e-20■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.861e-20■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.615e-7■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 26.87□□□□□ -1.311e-7■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 SARAF-210ENST00000522055 582 ntTSL 322.55■■□□□ 1.23e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-203ENST00000518174 1981 ntTSL 520.5■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-205ENST00000518340 582 ntTSL 319.62■□□□□ 0.733e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-206ENST00000520303 1803 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.693e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-235ENST00000617753 580 ntTSL 417.95■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-206ENST00000463260 1941 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.213e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 RNF138-206ENST00000580499 503 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MARS-215ENST00000548944 294 ntTSL 314.92□□□□□ -0.021e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-208ENST00000521265 1741 ntTSL 514.26□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 CPSF6-204ENST00000547486 872 ntTSL 214.19□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 PKM-209ENST00000563986 825 ntTSL 212.77□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 RNF138-202ENST00000261593 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.513e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-204ENST00000518296 878 ntTSL 210.4□□□□□ -0.743e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MARS-222ENST00000551172 699 ntTSL 39.69□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 KMT2E-206ENST00000474203 617 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 12.8
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