Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-202ENST00000366210 672 ntTSL 39.02□□□□□ -0.979e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 EIF3J-207ENST00000558353 1024 ntTSL 58.86□□□□□ -0.999e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 PRKAR2B-202ENST00000393613 642 ntTSL 38.85□□□□□ -0.999e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.039e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-211ENST00000526574 489 ntTSL 58.6□□□□□ -1.039e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 AFDN-217ENST00000507679 670 ntTSL 38.3□□□□□ -1.089e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-222ENST00000449239 599 ntTSL 27.85□□□□□ -1.159e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-TTLL3-204ENST00000453882 499 ntTSL 47.23□□□□□ -1.259e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 CLTC-205ENST00000472651 665 ntTSL 25.44□□□□□ -1.549e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.549e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ATP5E-202ENST00000395659 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-206ENST00000465881 883 ntTSL 57.98□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-215ENST00000638589 2225 ntTSL 26.02□□□□□ -1.452e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 317.23■□□□□ 0.359e-7■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.484e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-204ENST00000563985 688 ntTSL 214.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-203ENST00000562017 903 nt14.14□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 MT2A-205ENST00000567300 416 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-6■■□□□ 13.4
UTP3Q9NQZ2 FAM182B-203ENST00000424021 605 ntTSL 515.25■□□□□ 0.035e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-202ENST00000585540 501 ntTSL 314.62□□□□□ -0.075e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.395e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.565e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.625e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.695e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 PPP2CA-204ENST00000495833 739 ntTSL 29.39□□□□□ -0.915e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 STX2-202ENST00000344271 661 ntTSL 37.98□□□□□ -1.135e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.045e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.665e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-205ENST00000519690 3119 ntTSL 216.69■□□□□ 0.265e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 513.55□□□□□ -0.245e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 312.4□□□□□ -0.425e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-24■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 516.13■□□□□ 0.175e-15■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.015e-15■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.55□□□□□ -1.523e-8■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-204ENST00000478340 962 ntTSL 219■□□□□ 0.638e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-205ENST00000490335 632 ntTSL 216.96■□□□□ 0.318e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-203ENST00000467020 1069 ntTSL 316.07■□□□□ 0.168e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-202ENST00000464112 1063 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.218e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.48e-7■■□□□ 13.3
UTP3Q9NQZ2 WARS-233ENST00000556660 584 ntTSL 411.05□□□□□ -0.643e-8■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 WARS-213ENST00000554084 866 ntTSL 58.09□□□□□ -1.113e-8■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A37-209ENST00000521637 503 ntTSL 319.46■□□□□ 0.712e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A37-210ENST00000522164 571 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.48□□□□□ -1.374e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.286e-9■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 316.24■□□□□ 0.195e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 212.81□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 312.8□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 212.27□□□□□ -0.455e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 210.29□□□□□ -0.765e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 29.09□□□□□ -0.955e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.965e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.285e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.445e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 56.03□□□□□ -1.445e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 24.11□□□□□ -1.755e-6■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 13.2
UTP3Q9NQZ2 TMED9-202ENST00000505521 925 ntTSL 219.72■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 13.1
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-216ENST00000564656 552 ntTSL 415.99■□□□□ 0.155e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-206ENST00000561539 509 ntTSL 37.76□□□□□ -1.175e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt22.9■■□□□ 1.266e-7■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.285e-6■■□□□ 13
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.67■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-20■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.98□□□□□ -1.771e-20■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.861e-20■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.615e-7■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 26.87□□□□□ -1.311e-7■■□□□ 12.9
UTP3Q9NQZ2 SARAF-210ENST00000522055 582 ntTSL 322.55■■□□□ 1.23e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-203ENST00000518174 1981 ntTSL 520.5■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-205ENST00000518340 582 ntTSL 319.62■□□□□ 0.733e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-206ENST00000520303 1803 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.693e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-235ENST00000617753 580 ntTSL 417.95■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-206ENST00000463260 1941 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.213e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 RNF138-206ENST00000580499 503 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MARS-215ENST00000548944 294 ntTSL 314.92□□□□□ -0.021e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-208ENST00000521265 1741 ntTSL 514.26□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 CPSF6-204ENST00000547486 872 ntTSL 214.19□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 PKM-209ENST00000563986 825 ntTSL 212.77□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 RNF138-202ENST00000261593 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.513e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MCFD2-207ENST00000409913 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 SARAF-204ENST00000518296 878 ntTSL 210.4□□□□□ -0.743e-6■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 MARS-222ENST00000551172 699 ntTSL 39.69□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 KMT2E-206ENST00000474203 617 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-7■■□□□ 12.8
UTP3Q9NQZ2 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 12.8
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