Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF3AQ9Y496 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms